Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kcnip3Q9QXT8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Kcnip3Q9QXT8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Kcnip3Q9QXT8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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