Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyth1Q9QX11 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms