Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Psma6Q9QUM9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Psma6Q9QUM9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Psma6Q9QUM9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Psma6Q9QUM9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Psma6Q9QUM9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Psma6Q9QUM9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Psma6Q9QUM9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Psma6Q9QUM9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Psma6Q9QUM9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Psma6Q9QUM9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Psma6Q9QUM9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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