Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms