Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms