Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdc42ep4Q9JM96 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms