Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms