Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Thsd1Q9JM61 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Thsd1Q9JM61 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms