Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms