Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nectin3Q9JLB9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nectin3Q9JLB9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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