Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hmgn5Q9JL35 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms