Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AatfQ9JKX4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AatfQ9JKX4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms