Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx5Q9JKQ4 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms