Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms