Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trem1Q9JKE2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trem1Q9JKE2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trem1Q9JKE2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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