Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpf2Q9JJ80 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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