Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmbr1Q9JIT0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms