Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rb1cc1Q9ESK9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms