Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ush1cQ9ES64 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms