Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfcp2Q9ERA0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms