Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Clstn2Q9ER65 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn2Q9ER65 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms