Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn12Q9ER56 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms