Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhox9Q9EQM5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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