Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnmdQ9EP64 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TnmdQ9EP64 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms