Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl4Q9DCU6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms