Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ndufs3Q9DCT2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms