Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms