Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cmtm2aQ9DAR1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cmtm2aQ9DAR1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cmtm2aQ9DAR1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cmtm2aQ9DAR1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cmtm2aQ9DAR1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms