Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smim23Q9DAL0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms