Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms