Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D9D9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms