Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gtf3c6Q9D8P7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gtf3c6Q9D8P7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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