Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc91Q9D8L5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms