Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms