Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cldn22Q9D7U6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cldn22Q9D7U6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn22Q9D7U6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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