Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms