Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D5Q8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms