Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930449I24RikQ9D5E3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms