Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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