Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm3404Q9D506 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm3404Q9D506 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm3404Q9D506 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm3404Q9D506 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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