Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gcc1Q9D4H2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gcc1Q9D4H2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms