Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UvssaQ9D479 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms