Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfap53Q9D439 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms