Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx29Q9D3S3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx29Q9D3S3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx29Q9D3S3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx29Q9D3S3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx29Q9D3S3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snx29Q9D3S3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snx29Q9D3S3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snx29Q9D3S3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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