Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rufy3Q9D394 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms