Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt20Q9D312 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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