Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx20Q9D2Y5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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