Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms