Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SarnpQ9D1J3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms