Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmbr1lQ9D1E5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms